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【停止说明】小会员(别名:年费VIP会员)-生信分析数据挖掘

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小会员(别名:年费VIP会员)就是免费获取未来1年内上新的课程(25套,重点。不是任选,是统一的)+专属课程(30套),合计55套

1.有效期:一般是1年内,以获取55套课程为准。

2.视频内容:生信分析、数据挖掘(GEO、TCGA、SEER、TARGET等)为主,辅以SCI写作、科研作图统计、基金课题、meta分析方面。

3.服务说明:提供视频教程不是一对一教学,不含答疑、指导等其它服务!不是店铺全部的资料。

4.发放形式:内容发百度网盘链接,可以在线看,也可以下载,保存后永久有效。大部分有代码,个别是零代码操作的。

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未来上新的是没有目录的,因为未来上新的是以后新获取/新购买的。有上新会通知你!

未来上新的以生信分析数据挖掘为主。

(三)会员专属课程(30套,下单后一次性发放)

A01.GEO数据库挖掘入门万事屋

章节1:课前须知试看

课时1清晰度问题

课时2文本生物信息学讨论群

课时3文本润色简介

课时4文本温馨提示,什么人适合这个 可试看

章节2:生物信息学简介试看

课时5生物信息学简介(上)26:27可试看

课时6生物信息学简介(下)12:58

课时7数据挖掘核心思想30:46

章节3:GEO数据库

课时8GEO数据库(一)30:00

课时9GEO数据库(二)34:06

课时10GEO数据库(三)26:34

课时11GEO数据库(四)23:10

章节4:一个实例

课时12一个实例(1)-筛查差异基因29:45

课时13一个实例(2)-DAVID数据库的使用36:34

课时14一个实例(3)-GO数据库简介23:38

课时15KEGG数据库(上)-pathway的图如何看?09:30

课时16KEGG数据库(下)-KEGG里有什么?23:45

课时17PPI分析-STRING数据库(上)21:40

课时18PPI分析-STRING数据库(下)24:25

课时19Cytoscape的使用——可视化23:32

课时20Cytoscape的使用——实操37:13

课时21文本Cytoscape的使用——实操(中会使用到的数据包)

章节5:附送:关于生物信息学的其他知识(了解)

课时22什么是R语言?38:13

课时23什么是linux系统?20:31

课时24什么是blast?24:51

课时25生物信息数据库有哪些?47:44

课时26什么是三代测序技术?31:54

课时27什么是RNA-seq?(上)20:20

课时28什么是RNA-seq?(下)34:05

课时29什么是SNP检测?(上)13:58

课时30什么是SNP检测(下)07:37

章节6:课后练习题及答案

课时31文本检索及下载GPL196

课时32文本检索及下载GSE29272

课时33文本检索及下载GSM81022

课时34文本GSE19777检索结果解读

课时35文本如何找到GSE25724?

课时36文本从FTP site下载数据

A02.GEO|TCGA|Oncomine数据挖掘易学方

1、 数据挖掘概述

2、 GEO在线工具的应用

3、 GEO数据下载和数据质量分析

4、 原始数据预处理

5、 寻找差异基因及制作热图和火山图

6、 GO富集分析

7、 KEGG分析

8、 蛋白互作网络

9、 TCGA数据下载

10、TCGA数据整理和基因注释

11、寻找差异基因和制作5年生存率

12、Oncomine概述及Meta分析

13、Oncomine之差异分析及共表达分析

A03.不用编程挖掘GEO

课时01.课程介绍.flv

课时02.数据下载与筛选差异基因(一),fv

课时03.数据下载与筛选差异基因(二).flv

课时04.数据下载与筛选差异基因(三),flv

课时05.对多个芯片取交集差异基因.flv

课时06.GO富集分析.mp4

课时07.KEGG富集分析.mp4

课时08.蛋白互作网络分析(一).mp4

课时09.蛋白互作网络分析(二).mp4

课时10.筛选Hub基因.mp4

课时11.生存分析.mp4

A04.GEO数据库肿瘤微环境(免疫细胞/基质细胞/ESTIMATE)zxw

一、GEO数据库肿瘤微环境简介

二、软件准备

三、GEO数据下载

四、GEO数据注释

五、肿瘤微环境

六、肿瘤微环境评分和生存数据合并

七、肿瘤微环境评分和生存关系

八、肿瘤微环境评分和临床数据合并

九、肿瘤微环境评分和临床相关性分析

十、基质细胞分组差异分析

十一、免疫细胞分组差异分析

十二、肿瘤微环境差异交集

十三、基因名转化为基因id

十四、GO富集分析

十五、KEGG富集分析

十六、蛋白互作网络构建

十七、蛋白互作网络核心基因

十八、批量化生存分析输入文件准备

十九、批量化生存分析

A05.TCGA数据库肿瘤免疫细胞浸润分析云间

1.肿瘤免疫细胞浸润分析简介

09月04日 09:11 269次学习

2.数据准备与处理(上)

09月04日 09:12 140次学习

3.数据准备与处理(下)

09月04日 09:14 116次学习

4.CIBERSORT算法应用

09月04日 09:15 95次学习

5.TIMER数据库应用

09月04日 09:16 82次学习

A06.TCGA数据库挖掘之ceRNA网络构建zxw

第一章、TCGA数据库简介

第二章、软件安装

第三章、数据下载与提取

第四章、差异分析

第五章、差异lncRNA与差异miNRA比对

第六章、DEmiRNA靶基因预测

第七章、网络构建数据准备

第八章、构建ceRNA网络

第九章、生存分析

A07.TARGET之ceRNA狂人

课时1介绍08:04可试看

课时2批量获取TARGET数据01:36

课时3筛选差异的mRNA29:38

课时4筛选差异的miRNA06:17

课时5筛选差异的lncRNA04:04

课时6构建lncRNA-miRNA网络(一)13:36

课时7构建lncRNA-miRNA网络(二)08:20

课时8构建lncRNA-miRNA网络(三)08:27

课时9构建miRNA-mRNA网络(一)07:17

课时10构建miRNA-mRNA网络(二)04:52

课时11构建miRNA-mRNA网络(三)07:09

课时12ceRNA(一)16:11

课时13ceRNA(二)18:51

课时14批量生成lncRNA生存曲线13:10

课时15批量生成miRNA生存曲线07:59

课时16批量生成 mRNA生存曲线09:02

课时17相关性分析09:43

课时18GO_KEGG富集分析

A08.SEER数据之临床预测模型狂人

课时1介绍07:52可试看

课时2SEER数据库账号的注册11:25

课时3SEER数据的获取16:40

课时4数据格式的准备21:31

课时5多因素的Cox回归模型13:05

课时6绘制列线图11:54

课时7利用C-index评价模型10:05

课时8利用ROC评价模型15:09

课时9利用校准图评价模型17:07

课时10模型验证12:39

课时11KM生存分析

A09.SEER数据库识别相关临床信息预后生信仁

章节1:SEER数据库识别相关临床信息预后能力-讲解试看

课时1分析流程概述03:13可试看

课时2PC临床数据获取及预处理03:58

课时3LNR与其他临床指标的相关性02:09

课时4LNR与其他临床病理特征的预后显著性02:21

课时5列线图的构建及评价02:18

课时6比较列线图与AJCC8th分期系统的预后价值02:03

章节2:SEER数据库识别相关临床信息预后能力—代码

课时7代码讲解37:44

课时8文本讲解ppt和资料

A10.铁死亡4+纯生信文章套路(免疫细胞/ssGSEA)TCGA联合ICGCzxw

一、铁死亡文章套路简介

二、软件准备

三、转录组数据下载

四、转录组数据整理

五、id转换

六、临床数据下载

七、临床信息提取

八、提取铁死亡相关基因

九、差异分析

十、生存分析输入文件

十一、预后相关基因

十二、交集基因

十三、热图绘制

十四、森林图绘制

十五、蛋白互作网络

十六、相关性网络

十七、ICGC数据下载

十八、ICGC数据整理

十九、ICGC生存分析输入文件

二十、预后模型构建

二十一、生存曲线绘制

二十二、ROC曲线

二十三、风险曲线

二十四、PCA分析和t-SEN分析

二十五、TCGA独立预后分析

二十六、ICGC独立预后分析

二十七、风险差异分析

二十八、GO富集分析

二十九、KEGG富集分析

三十、免疫打分(ssGSEA)

三十一、免疫打分相关性分析

A11.肿瘤突变负荷联合免疫细胞浸润生信视频TCGA数据库TMB预后模型生信分析报告

一、TCGA数据库肿瘤突变负荷基本概念07:14

二、肿瘤突变负荷常见图形介绍07:36

三、突变负荷和生存及临床关系简介07:19

四、表达根据突变负荷分组做差异介绍07:30

五、突变负荷与免疫浸润的关系简介07:34

六、TCGA突变数据下载11:11

七、常见突变图形绘制19:50

八、计算肿瘤突变负荷09:49

九、TCGA临床数据下载05:34

十、临床数据提取08:16

十一、准备生存分析输入文件07:48

十二、绘制生存曲线10:37

十三、准备临床相关性文件09:15

十四、临床相关性分析08:20

十五、表达数据下载09:34

十六、表达数据整理09:47

十七、ID转换07:41

十八、表达数据按TMB分组09:21

十九、差异分析12:36

二十、绘制差异热图11:32

二十一、symbol转换为id08:25

二十二、GO富集分析13:12

二十三、KEGG富集分析10:33

二十四、数据矫正10:04

二十五、免疫细胞组成09:15

二十六、对免疫细胞矩阵分组11:10

二十七、视频TMB与免疫细胞关系

B01.初学者必备:零代码,手把手教你发3分生信文章医学科研汇

01.简介.mp4

02 文献通读mp4

03 GEO2R分析芯片数据mp4

04 韦恩图绘制.mp4

05 STRING网站使用方法mp4

06 Cytoscape软件及MCODE使用方法mp4

07 基因预后分析.mp4

08 GEPIA网站分析mp4

09 GO基因富集分析mp4

10 KEGG功能分析.mp4

11 KEGG通路图绘制.mp4

B02.零基础,零代码发表4分生信SCI弗雷塞斯

课时1介绍07:42可试看

课时2GEO数据库介绍12:20可试看

课时3GEO数据库在线分析工具介绍10:51

课时4从GEO数据集中筛选差异分子13:07

课时5SangerBox软件简单介绍07:56

课时6Enrichr数据库介绍及操作07:20

课时7FunRich工具介绍及操作09:14

课时8枢纽基因的筛选15:28

课时9Oncomine数据库介绍及操作16:37

课时10UALCAN数据库介绍及操作12:52

课时11GEPIA数据库介绍及操作18:11

课时12miRNA背景知识介绍(miRBase)15:49

课时13miRNA靶标预测网站介绍17:58

课时14在线韦恩图制作网站08:04

课时15miRCancer数据库介绍06:35

课时16OncomiR数据库介绍12:21

课时17文献复原

B03.零基础数据挖掘dxy

第一章:如何通过数据挖掘发表高分 SCI 文章?

前言 | 如何用好公开的数据库给自己发文章?14分20秒

(试听)如何通过数据挖掘寻找研究方向和研究基础?3分47秒

(试听)涉及的数据库汇总与GEO2R 常见问题解答15分32秒

(试听)2张图片撑起一篇JAMA:一篇非常优秀的数据挖掘文章展示6分29秒

1.1 学好数据挖掘,能从这 3 个方向获益匪浅(上)21分58秒

1.2 学好数据挖掘,能从这 3 个方向获益匪浅(下)18分51秒

1.3 经典解析:2节课带你读懂数据挖掘文章(上)28分59秒

1.4 经典解析:2节课带你读懂数据挖掘文章(下)25分29秒

第二章:15+数据库挖掘实战演示

2.1 基因数据库综合使用:NCBI/Ensemble/GeneCards 数据库(上)-有作业25分56秒

2.2 基因数据库综合使用:NCBI/Ensemble/GeneCards 数据库(下)33分44秒

2.3 GEO 数据库的架构: 数据类型,检索技巧,关键数据缺失的解决办法.47分55秒

2.4 基于 GEO 数据库的疾病数据库: ArrayExpress,Oncomine等数据库(上)33分7秒

2.5 基于 GEO 数据库的疾病数据库: ArrayExpress,Oncomine等数据库(下)41分55秒

2.6 TCGA-ICGC & GTEx 数据库的关系与使用(含基础知识)48分52秒

2.7 TCGA 相关的在线工具: Cbioportal-GEPIA-OncoLnc数据库(上)1时6分41秒

2.8 TCGA 相关的在线工具: Cbioportal-GEPIA-OncoLnc数据库(下)55分33秒

2.9 蛋白互作及调控网络数据库: STRING, Panther, Reactome, KEGG等蛋白调控网络数据库43分52秒

2.10 蛋白表达分析数据库: ProteinAtlas(HPA)40分52秒

2.11 热门分子研究类数据库汇总:疾病,lncRNA,mirRNA,免疫浸润,外泌体40分1秒

2.12 单细胞数据挖掘中的数据库:GEO、Panglaodb、HCA等8个单细胞方向数据库(上)0分0秒

2.13 单细胞数据挖掘中的数据库: GEO、Panglaodb、HCA等8个单细胞方向数据库(下)34分42秒

2.14 如何寻找目标数据库:寻找细分方向的小众数据库为文章增色45分16秒2.15 数据库总结与答疑精选45分16秒

2.16 加餐 Google 搜索小技巧27分20秒

第三章:手把手教你,如何选择最适合的分析方法?

3.1 常用数据挖掘软件的安装与介绍: RRstudioCytoscape50分4秒

3.2 数据挖掘实战第一步:选题、选择研究对象47分22秒

3.3 分子类数据挖掘:如何找基因、基因集?43分59秒

3.4 富集分析与气泡图:WebGestalt(上)39分59秒

3.5 富集分析与气泡图:Enrichr(下)14分36秒

3.6 生物分子网络分析及操作: 网络基因与Hub基因计算(上)25分45秒

3.7 生物分子网络分析及操作: 网络基因与Hub基因计算(下)32分49秒

3.8 miRNA & mRNA联合多组学分析32分51秒

3.9 临床生存分析原理:统计检验、作图、代码34分41秒

3.10 其他高级分析及文章增色补充: 检索最新热点并寻找相关数据库35分11秒

3.11 温故知新:复现数据挖掘SCI文章的图表(上)34分20秒

3.12 温故知新:复现数据挖掘SCI文章的图表(下)26分11秒

3.13 加餐: Seer 数据库的注册以及数据获取27分17秒

3.14 加餐: Seer 数据库的文章思路解析42分21秒

第四章:如何成功发表—写作与选刊

4.1 教你规划一篇数据挖掘文章的全部内容40分44秒

4.2 数据挖掘类文章的写作框架37分32秒

4.3 数据挖掘SCI论文投稿和选刊注意事项34分36秒

B04.不用做实验的4分+网络药理学复现百味科研

01网络药理学介绍

02拆解4分文章套路

03有效成分获取

04有效成分靶点获取

05疾病基因获取

06网络可视化

07KEGG/GO 功能富集分析

08分于对接模拟

B05.生物医学大数据挖掘及生物信息学案例分析进阶医萌

(一)风险snp识别与候选疾病基因验证.mp4

(二)gwas关联分析资源与拓展应用mp4

(三)snp关联分析与互作分析的软件实现.mp4

(五)基因测定平台及数据库介绍.mp4

(四)snp功能分析的生物信息学方法.mp4

(七)基因功能分析及david网络工具应用.mp4

(六)基因芯片数据的预处理分析.mp4

(九)表观遗传学概念及dna甲基化数据分析.mp4

(八)综合案例解析r软件实操.mp4

(十)肿瘤甲基化数据库及突眼症的dna全基因组甲基化数据分析.mp4

(十一)拷贝数变异数据分析的软件实现.mp4

(十二)非编码rna、mirna的概念数据分析及数据库应用.mp4

(十五)Incrna概念及数据库介绍.mp4

(十四)案例解析∶ snp-mirna联合分析.mp4

(十三)案例解析∶ mirna-mrna双重表达谱的联合分析.mp4

(十六)分类与聚类的应用实例.mp4

(十七)统计方法批处理的r程序mp4

(十八)生物信息学数据分析整合思路.mp4

(十九)如何回答reviewer问题的一点建议.mp4

B06.生物信息学常用数据库介绍与科研应用系列医萌

(一)genbank,nucleotide核苷酸序列,protein蛋白序列.mp4

(二)refseq参考序列数据库.mp4

(三)blast比对工具mp4

(五)myc功能信息及myc参与的信号通路.mp4

(四)genecards数据库及myc基因在不同数据库中的描述mp4

(七)ncbientrez gene数据库.mp4

(六)myc相关的药物信息及myc基因上的snp.mp4

(九)常用基因组数据库介绍(下).mp4

(八)常用基因组数据库介绍(上).mp4

(十)uniprot数据库介绍及使用方法.mp4

(十一)pfam数据库的介绍及使用方法.mp4

(十二)string数据库的介绍及使用方法.mp4

(十二)mirna相关数据库的介绍.mp4

(十三)incrna相关数据库的介绍.mp4

(十四)非编码rna综合数据库介绍及Incrna fam201a实例分析.mp4

B07.代谢组学数据分析技术及应用培训中科

1.代谢组学简介及样本的采集与制备关键问题探讨

(1)  概述(2)  操作流程及关键点(3)  样本的采集、储存与制备关键问题探讨

2.代谢组学数据采集与预处理,预处理决定数据统计结果的准确性

(1)  常用技术平台介绍(NMR和LC-MS)(2)  常用软件和数据库介绍(代谢物鉴定与数据分析)(3)  数据预处理,包括数据归一化(面积归一化、质量归一化等如何选择)、标准化(Par、UV、Ctr)和数据转化以及缺失值评估

3.代谢组学常规数据分析以及SIMCA-P软件安装和实操

(1)  SIMCA-P软件安装及功能介绍(2)  样本分类(PCA、PLS-DA、OPLS-DA)(3)  重要变量选择(差异代谢物筛选),包括S-plot,S+V-plot,VIP等(4)  常见图形结果解读

4.基于MetaboAnalyst网站的代谢组学数据高级分析

(1)  数据导入技巧(2)  数据预处理(3)  火山图(Volcano Plot)(4)  热图(Heatmap)(5)  相关分析(6)  代谢通路分析(pathway)

B08.5节课轻松掌握代谢组学分析云间

1.初步认识代谢组学

03月07日 17:44 862次学习

2.MetaboAnalyst-代谢组学神器

03月07日 17:53 361次学习

3.R语言入门-R的常用操作

03月07日 18:02 254次学习

4.R的进阶学习-绘图系统

03月07日 18:08 194次学习

5.成功之路-R实现代谢组学分析

03月07日 18:13 270次学习

C01.临床预测模型从入门到精通dxy

冠心病 10 年风险预测评分工具——被引用近 1 万次的临床预测模型7分12秒

如何解决科研需求,提升临床决策能力?19分5秒

哪些数据适合构建临床预测模型?6分37秒

如何通过做菜步骤,2 分钟了解临床预测模型研究流程?1分57秒

如何根据 PI(E)COtS 设计临床预测模型课题?10分58秒

第一章 如何识别预测模型研究?

如何加入班级交流群,与讲师交流讨论?1分49秒

1.1 预测模型新手必学:诊断模型 or 预后模型?18分51秒

1.2 五种模型研究分类实例讲解与对比分析21分32秒

1.3 十步构建临床预测模型:像烹饪一样简单16分59秒

【加餐】12.10号临床预测模型文章经验分享回放1时1分26秒

第二章 如何设计课题,如何选择合适数据?

2.1 如何根据 PI(E)COtS 设计课题:不同研究类型对应的模型设计方案15分39秒

2.2 如何选择合适的数据:现有数据 or 研究数据;训练集 or 验证集?15分55秒

2.3 四种统计模型如何选择:文献实例解析15分14秒

2.4 三个维度筛选预测因子方法:文献实例解析18分52秒

2.5 零基础 R 语言实操附代码包 135分26秒

2.6 零基础 R 语言实操附代码包 225分49秒

2.7 零基础 R 语言实操附代码包 330分14秒

第三章 如何清洗与处理数据,并进行变量转换与变量选择?

3.1 单因素分析 1:如何对结局指标进行处理?45分14秒

3.2 单因素分析 2:如何处理错误值,异常值和缺失值?1时0分5秒

3.3 单因素分析 3:连续变量 or 分类变量?32分12秒

3.4 单因素分析 4:如何对变量进行转换?41分48秒

3.5 多因素分析:两种预测因子筛选方法及实例解析51分24秒

3.6 如何对模型进行拟合,完成构建(上)28分18秒

3.7 如何对模型进行拟合,完成构建(下)29分0秒

第四章 如何评价预测模型表现并进行验证?

4.1 两种模型评价方式 :内部验证与外部验证如何选择?13分27秒

4.2 预测模型表现的评价指标解析25分10秒

4.3 如何对模型进行随机拆分验证37分50秒

4.4 如何对模型进行 k 折交叉验证34分30秒

4.5 如何利用Bootstrap方法对模型进行内部验证38分43秒

4.6 如何对模型进行“内部-外部”交叉验证15分15秒

4.7 内部验证方法对比及选择总结15分17秒

4.8 外部验证方法与难点总结(上)1时2分0秒

4.9 外部验证方法与难点总结(下)50分9秒

4.10 新模型与现有模型的比较33分23秒

勘误:如何用 Cox 模型计算预测生存概率?16分11秒

第五章 如何展现预测模型,可视化工具对比与选择

5.1 5种预测模型可视化工具对比与选择10分5秒

5.2 如何用 APP、网页展现模型并进行分析?29分19秒

5.3 列线图:Nomogram 可视化工具实操11分49秒

5.4 评分系统:展现方式与工具实操10分52秒

5.5 打分卡:Graphical score chart展现方式与实操5分59秒

第六章 如何写出一篇符合国际标准的临床预测模型文章?

6.1 临床预测模型报告准则:TRIPOD 申明与检验清单解读(上)53分50秒

6.2 临床预测模型报告准则:TRIPOD 申明与检验清单解读(下)26分11秒

6.3 TRIPOD 写作框架:引言,方法,结果,讨论48分32秒

6.4 PROBAST 方法学评价41分59秒

6.5 PROBAST应用实例32分59秒

6.6 CHARMS介绍及工具总结13分2秒

第七章 三种临床预测模型实操案例复现

7.1 基于 Logistic 模型的案例展示49分43秒

7.2 基于 Cox 回归的案例展示43分55秒

7.3 基于线性回归的案例展示33分2秒

第八章 实操误区解析与学员问题答疑

8.1 研究设计与数据选择中的错误案例解析29分28秒

8.2 病例对照与 RCT,建模的重新校准怎么做?20分18秒

8.3 如何选择生存分析 Cox 模型中 time scale?21分4秒

8.4 如何做好多重插补之后的建模?18分40秒

8.5 如何做决策曲线分析?28分1秒

8.6 案例分析与优劣对比:机器学习 VS 传统模型24分15秒

C02.R语言与生物信息绘图万事屋学习笔记

章节1:课前须知试看

课时1文本视频清晰度问题可试看

课时2文本课程涉及到的辅助文件下载地址

课时3文本润色业务简介

章节2:PPT

课时4文本R语言基础介绍

课时5文本R语言绘图参数详解

课时6文本如何使用R绘制条形图

课时7文本如何使用R绘制分布图

课时8文本如何使用R绘制箱线图

课时9文本如何使用R绘制韦恩图

课时10文本如何使用R绘制火山图

课时11文本如何使用R绘制聚类图

课时12文本如何使用R绘制热图

课时13文本如何使用R绘制3D图

章节3:视频

课时14视频R语言基础介绍34:22

课时15视频R语言绘图参数详解28:59

课时16视频如何使用R绘制条形图18:17

课时17视频如何使用R绘制分布图31:31

课时18视频如何使用R绘制箱线图19:53

课时19视频如何使用R绘制热图24:48可试看

课时20视频如何使用R绘制韦恩图20:58

课时21视频如何使用R绘制火山图22:30

课时22视频如何使用R绘制聚类图需购买观看

课时23视频如何使用R绘制3D图

C03.R语言入门与数据挖掘实战dxy

第一章 福利

福利 1 :如何将 R 语言应用在临床实际场景?4分54秒

福利 2:10 行代码教会你 R 语言的规则9分19秒

福利 3 :R 包安装过程中常见报错如何解决?5分59秒

第一章 R 语言强大在哪?如何顺利安装?

1.1 数据挖掘为什么要学 R,怎么学?32分44秒

1.2 R 的安装与常见报错如何解决?34分40秒

第二章 手把手教你入门 R 语言

2.1 R studio 项目代码数据管理技巧44分17秒

2.2 R 语言的基本数据类型:数值、字符串、逻辑37分8秒

2.3 R 语言的基本数据结构:向量、因子、数据结构1时2分58秒

2.4 R 语言数据读写与存取:txt、csv、excel统统搞定56分42秒

2.5 R 语言的基本数据结构:矩阵的常用函数及在数据挖掘中的应用场景41分59秒

2.6 R 语言的基本数据结构:数据框的常用函数及在数据挖掘中的应用场景49分43秒

2.7 R 语言的基本数据结构:列表的常用函数及在数据挖掘中的应用场景40分4秒

2.8 数据结构之间的转换、高频函数、数据挖掘应用实例练习题50分55秒

第三章 强大的 R 语言函数应用与统计分析

3.1 R 函数:循环的原理与语法,数据挖掘实例练习58分58秒

3.2 R 函数:apply 的原理与语法,数据挖掘实例练习40分55秒

3.3 自定义函数—Function:自己编程个性化处理数据35分57秒

3.4 R 语言中实现大部分常用的统计分析54分0秒

第四章 R 语言实战:数据挖掘与作图

4.1 如何用 R 获取公共数据,管理数据,实现单一代码的重复应用29分12秒

4.2 R语言可视化最强包-ggplot2 绘图29分55秒

4.3 GEO数据下载、清洗以及韦恩图绘制42分5秒

4.4 下载 TCGA 临床数据,绘制bar图、小提琴图、盒状图53分5秒

4.5 差异表达基因分析以及火山图绘制59分0秒

4.6 用 R 语言进行聚类分析,绘制热图36分19秒

4.7 公共数据下载,富集分析,绘制 GO;KEGG bar图、气泡图、GSEA分析图28分46秒

第五章 R 语言实战:临床统计分析

5.1 临床统计 R 实战:生存分析及 KM 曲线森林图21分14秒

5.2 临床统计 R 实战:多因素预后模型构建 Nomogram 列线图25分24秒

5.3 临床统计 R 实战:PCA 分析、ROC 曲线28分4秒

5.4 分子+临床批量关联分析寻找文章亮点18分31秒

5.5 WGCNA 基本分析联合临床相关性分析-128分20秒

5.6 WGCNA 基本分析联合临床相关性分析-221分36秒

第六章 复现数据挖掘全篇

6.1 一篇生信文章的代码拆解29分18秒

6.2 高分文章中学习数据挖掘的方法31分17秒

6.3 中高级数据挖掘文章的规划思路25分11秒

C04.Perl语言在生物信息学中的应用zxw

课时1perl生信分析应用简介18:30可试看

课时2Perl标量27:11

课时3数组18:48

课时4哈希14:48

课时5引用22:19

课时6命令行输入参数12:21

课时7split和join函数13:48

课时8正则表达式27:59

课时9读写文件12:15

课时10生信应用一数据合并13:31

课时11生信应用二基因名字转换成id13:45

课时12生信应用三GC含量统计14:12

课时13生信应用四DNA2protein12:41

课时14子程序13:14

课时15生信应用五任务调度13:07

课时16生信应用六目录操作

C05.SCI写作训练营dxy

1.0 开学典礼mp4

1.1 选题是成功的一半.mp4

1.2 如何构建英文写作环境?.mp4

1.3 写作前必须要知道的几件事儿.mp4

2.1 结构化写作∶ Results.mp4

2.2 结构化写作∶Materials and Methods.mp4

2.3 结构化写作∶Introduction.mp4

3.1 结构化写作∶discussion.mp4

3.2 结构化写作∶Reference And Endnote的使用.mp4

3.3 结构化写作∶ Title.mp4

4.1 结构化写作∶ Figure Legends.mp4

4.2 结构化写作∶ Abstract And Key words.mp4

4.3 结构化写作∶Acknowledge and Supplement.mp4

5.1 如何从图表制作提高文章的层次?.mp4

5.2 选刊与英文润色的原则与工具mp4

5.3 医学伦理与原始数据决定了是否被撤稿.mp4

6.1 SCI 期刊稿件处理流程与几封关键 letter 的写作.mp4

6.2 如何回答审稿人的问题?.mp4

6.3 稿件被拒后该何去何从?.mp4

8.1 临床文章写作专题∶Meta 分析.mp4

8.2 临床文章写作专题∶临床研究.mp4

8.3 英文写作实战分享mp4

结构化写作∶ Acknowledge and Supplement.mp4

C06.中文医学核心期刊论文撰写与投稿技巧dxy

第一章 简介

节选:如何更快找到接受自己论文的好期刊16分12秒

节选:一些错误的论文题目示例6分53秒

1.1 本门课将教会你什么?中文核心的定位在哪?29分13秒

第二章 临床研究的选题与设计

2.1 临床研究的选题原则:创新性、科学性、实用性21分20秒

2.2 不同类型临床研究论文的设计「套路」及选题技巧46分51秒

2.3 临床研究设计的「三性」和切入点选择34分56秒

2.4 临床研究常用的统计方法与常见错误16分22秒

第三章 掌握论文撰写要点

3.1 一篇典型的医学论文的结构41分55秒

3.2 内容与行文:把审稿人既当内行又当外行30分11秒

3.3 细节决定成败:撰写规范和细节处理46分31秒

3.4 比别人多做一点:在审稿过程中为您加分21分47秒

第四章 洞察期刊需要,提高投稿成功率

4.1 中文科技期刊的“鄙视链”与江湖门派5分29秒

4.2 如何更快找到接受自己论文的好期刊16分12秒

4.3 如何找到合适投稿的期刊,鉴别假期刊22分11秒

4.4 与审稿人沟通的正确方式24分58秒

C07.常用研究设计类型、医学统计方法的选择及错误辨析医萌小狗

(一)医学统计方法介绍及统计工作的基本步骤.mp4

(二)研究设计与实验设计基本要素.mp4

(三)统计数据类型及统计方法的分类与选择.mp4

(四)结合实例讨论统计学方法的选择.mp4

(五)论文的统计学审查及应避免的系统学错误mp4

(八)统计表设计与应用实例.mp4

(九)统计图的分类与选择.mp4

(六)统计方法的选择及常见错误(计量资料)-1.mp4

(七)统计方法的选择及常见错误(计数资料).mp4

(十)统计图的应用案例.mp4

(十一)医学论文中的统计表达及分析.mp4

(十二)结合实例讲解写作与发表的规范.mp4

C08.如何从临床工作中get科研思路医萌小狗

(一)中国临床医生科研现状剖析.mp4

(二)课题想法来源.mp4

(三)结果解读与实例分析.mp4

(五)课题的开展与实例解析.mp4

(四)课题的深入与演化.mp4

(七)课题分层实例解析.mp4

(六)不同角度的课题延伸与注意事项.mp4

(九)申报思路与立项依据.mp4

(八)基金申报条件与课题思路.mp4

(十一)研究内容、研究目标及拟解决的问题.mp4

(十二)标书其余部分的撰写与实例解析(上).mp4

(十)立项时需注意的问题实例解析.mp4

(十三)标书其余部分的撰写与实例解析(下).mp4

(十四)sci文章撰写.mp4

C09.临床医学科研设计系列小狗 

1 如何提出与选择临床研究问题.mp4

2 临床研究资料的收集与整理mp4

3 研究设计中常见问题解析.mp4

4 临床研究方法概述.mp4

5 队列研究的方法及应用.mp4

6 病例对照研究方法及应用.mp4

7 病例对照研究衍生类型.mp4

8 实验性研究方法及应用.mp4

9 系统评价方法.mp4

10 meta分析方法.mp4

11 系统评价原则及应用.mp4

12 临床疗效比较研究方法及应用.mp4

C10.基金标书写作与申报技巧dxy

第 1 节 总体介绍9分43秒

第 2 节 国家自然科学基金概述15分1秒

第 3 节 选题与题目47分12秒

第 4 节 立项依据50分24秒

第 5 节 研究内容、研究目标和拟解决的关键问题33分22秒

第 6 节 研究方案13分51秒

第 7 节 可行性分析4分40秒

第 8 节 本项目的特色与创新之处7分53秒

第 9 节 年度研究计划与预计结果12分35秒

第 10 节 研究基础与工作条件23分34秒

第 11 节 主要参与者、简历及代表性成果12分38秒

第 12 节 摘要与关键词13分16秒

第 13 节 预算表及说明书12分47秒

第 14 节 在线填报流程17分26秒

第 15 节 国自然评审23分18秒

第 16 节 标书写作中的常见问题解析13分0秒

第 17 节 深度挖掘国自然基金委官网(上)17分34秒

第 18 节 深度挖掘国自然基金委官网(下)12分11秒

第 19 节 从评审人的角度写标书-谈谈我的基金评审体会29分58秒

第 20 节 “屌丝“变”土豪“——基金课题申请之路1时27分36秒

第 21 节 标书写作中文献全文获取的5个途径22分40秒

C11.Meta分析实操复现训练营(第四期)dxy学习笔记688

软件安装准备

【软件安装准备】1.Stata安装视频.ts

【软件安装准备】2.RevMan 安装视频.ts

【软件安装准备】3.Endnote 安装视频.ts

【软件安装准备】4.NoteExpress 安装视频.ts

第一周 新手必须要掌握的 Meta 分析流程与标准

1.1 想掌握 Meta 分析,一定要搞懂这几个点!

1.2 临床研究原始研究类型及效应量介绍

1.3 Meta 分析制作步骤及发表标准

1.4 Meta分析注册平台简介及操作与第一周作业布置

第二周 如何制定纳入排除标准,快速查全查准文献?

2.1 Meta 选题原则与两大选题实例

2.2 如何制定合适的纳入和排除标准?

2.3 做 Meta 应该检索哪些数据库?如何进行检索?

2.4 检索实例演示:如何制定中英文检索策略?(第二周作业布置)

第三周 中文数据库检索步骤及操作

3.1 CBM 数据库检索方法与两大实例演示

3.2 知网 数据库检索方法与两大实例演示

3.3 万方 数据库检索方法与两大实例演示

3.4 维普 数据库检索方法与两大实例演示

3.5 中国临床试验注册中心检索实操(第三周作业布置)

第四周 英文数据库检索步骤及操作

4.1 PubMed 数据库检索方法与两大实例演示

4.2 Embase 数据库检索方法与两大实例演示

4.3 Web of science 数据库检索方法与两大实例演示

4.4 Cochrane library 数据库检索方法与两大实例演示

第五周 文献筛选、质量评价及数据提取实操

5.1 文献管理:Endnote 和 NoteExpress 软件界面介绍

5.2 文献筛选:Endnote 和 NoteExpress 筛选文献实操

5.3 文献筛选图:用 GraphPad Prism 软件绘制文献筛选流程图

5.4 文献质量评价:用 Cochrane 工具与NOS 量表进行质量评价实操

5.5 数据提取及效应量讲解:两种数据提取实例演示

第六周 Meta 数据统计分析软件实操(上)

6.1 RevMan 和 STATA 软件安装与界面介绍

6.2 流程实操:如何用两个软件进行 Meta 数据分析?

6.3 如何对无异质性的二分类变量进行 Meta 数据分析?

6.4 如何对有异质性的二分类变量进行 Meta 数据分析?

第七周 Meta 数据统计分析软件实操(下)

7.1 如何对单臂研究的二分类变量进行 Meta 数据分析?

7.2 如何对单臂研究的连续变量进行 Meta 数据分析?

7.3 如何对连续变量进行 Meta 常规数据分析与亚组分析?

7.4 如何做疾病影响因素 Meta 分析?(OR)

7.5 如何对生存资料进行 Meta 常规数据分析与亚组分析?

7.6 课程总结:Meta分析进阶、易错点归纳及注意事项

学习心得

作为一名科研工作者,时时刻刻都在和时间赛跑。吾必须时时刻苦钻研科研,掌握现代科研的知识和技能。愿在未来,不忘初心,牢记使命。只争朝夕,不负韶华,为成为一名优秀的科研工作者而努力,努力践行科学发展观,认真学习科学发展观努力做好本职工作。

科学技术是人类社会发展的原动力。要将“做科研”培养成为一种兴趣,将实践和科研思维结合进行科学创新,才能真正推进科技进步。要如何做研究?--从实践中发现问题;运用知识储备提出问题;依赖先进的技术研究问题;最终的研究成果,要不忘初心,应用于解决实践中的问题上。

读书学习之道,看似无边无际,不知何去何从,倘若勤奋刻苦,书山自有石经,学海岂无彼岸。故不积跬步,无以至千里;不积小流,无以成江海。作为科研工作者,吾应发奋图强,刻苦学习!方能在科研方面更进一步!

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