实用技能-生信科研网

【生信技能】生信服务器/生物信息学云服务器

公众号：生信豆芽菜（短租）共享服务器 (CPU: 22核44线程，运行内存: 512G)具体价格: 60元/月，仅充值一个月 50元/月，一次性充值半年 45元/月，一次性充值一年独享服务器，一机一账号:入门级...

实用技能
2023-09-22
0
生信科研网

【生信技能】R安装包遇到无法在貯藏處读写索引的报错/安装包失败解决办法/更换镜像

解决方法1安装R包的时候遇到无法在貯藏處https://mirrors.e-ducation.cn/CRAN/src/contrib中读写索引类似的报错Warning: 无法在貯藏處https://mirrors.e-ducation.cn/CRAN/src/contrib中读写索引: 无法打开URL'https://mirrors.e-ducation.cn/CRAN/src/contrib/PACKAGES'参考https://www.codenong.com...

实用技能
2023-09-07
0
生信科研网

【生信技能】新版TCGA数据库转录组更新和perl脚本使用说明

重点、重点、重点（第一次用请看3遍以上）：TCGA改版之后，TCGA下载转录组数据页面只有STRA-Counts，处理方法也更新了。2022年03月改版前：3个步骤（02.转录组数据下载、03.转录组数据整理、04.id转换）+3个脚本处理（moveFiles.pl、merge.pl、symbol.pl）。2022年03月改版后：2个步骤（03.转录组数据下载、04.转录组数据整...

实用技能
2023-07-10
0
生信科研网

【生信技能】生信自学网perl脚本不能用的一些处理方法

【生信技能】生信自学网perl脚本不能用的一些处理方法，非万能一、卸载之前的perl软件，然后重启电脑，然后安装perl 5.30.0版本软件，只能是win系统。网盘地址：链接：https://pan.baidu.com/s/1QIvxSnO-Eh-u2bw8L3ibmg提取码：ovhnPerl官网下载地址：https://strawberryperl.com/releases.html二、修改电脑时间（破解时间限...

实用技能
2023-03-24
0
生信科研网

【生信技能】R代码注释内容出现乱码-如何使用RStudio进行转码

R代码注释内容出现乱码-如何使用RStudio进行转码点击File-Reopen with encoding-选中BG18030...

实用技能
2023-03-16
0
生信科研网

【生信技能】R计算平均数、中位数百分位数_R语言：用R计算各种统计值

求极差(range)做频数分布表和频数分布图(graph of frequency distribution)算术平均数(mean)几何均数(geometric mean)中位数与百分位数(median and percentile)四分位间距(quartile range)方差(variance)标准差(standard deviation)变异系数(coefficient of variance)正态分布(normal distribution)标准正态分布(standard n...

实用技能
2022-12-05
0
生信科研网

【生信技能】cmd终端如何进入非C盘的其他盘文件夹

cmd终端操作，有一些技巧，如果大家把资料放在C盘，那么直接cd空格带上文件目录，按回车就可以进入了，但是进入其他盘的？有学员也直接cd空格带上文件目录，发现进不去，然后后面运行就无法继续操作很简单，比如我们要进入F盘的文件夹，那么在cmd终端输入“F:”（其他盘也一样，比如进入D盘就输入D:），然后按回车这样就进入...

实用技能
2022-10-30
0
生信科研网

【生信技能】kegg运行报错fail to download KEGG data

最近kegg运行会遇到报错现象，首先来看下报错的界面内容：Reading KEGG annotation online:fail to download KEGG data...Error in download.KEGG.Path(species) : 'species' should be one of organisms listed in 'http://www.genome.jp/kegg/catalog/org_list.html'...此外: Warning...

实用技能
2022-10-30
0
生信科研网

【生信技能】使用SVM-RFE时需要注意的那些坑

最近小云在学习做免疫细胞鉴定时，遇到了些问题，困扰了许久，浪费了不少时间，今天小云就来分享分享做免疫细胞鉴定分析是遇到的那些坑，跟随小云一起来看看吧。01文件格式问题首先是分组信息，要注意文件的格式，假设我们使用的是制表符分割的.tx文件，那么我们在保存时就要注意unicode文本的bxt，由于都是txt文件稍微不小...

实用技能
2022-10-16
0
生信科研网

【生信技能】机器学习SVM-RFE筛选特征基因R代码解释

#SVM-RFE分析Profile=rfe(x=data, y=as.numeric(as.factor(group)), sizes = c(2,4,6,8, seq(10,40,by=3)), rfeControl = rfeControl(functions = caretFuncs, method = "cv"),&nb...