【生信技能】R语言R软件如何更新升级？

第一、R版本更新

使用R语言的tune包做超参数调优时，提示没有安装这个包。很自然地，先安装这个R包，安装过程报错，提示无法安装。因为目前的R版本太低，不支持。至少需要R3.6.3。

于是乎，寻找有效更新R版本的解决方案。

对于Win10系统，可以采用下面的方法，做R版本的更新。

第一步：打开RGui，安装installr包。

install.packages('installr')

第二步：加载installr包，使用updateR函数更新R版本，采用了清华大学的CRAN镜像。

library(installr)
updateR(cran_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")#选择了清华大学的CRAN镜像

正常运行后，会出现一系列提示框，按着提示框信息，进行相应操作。这些提示框的信息包括R目前最新的版本，最新版的介绍，是否下载最新版本，下载成功后，点击安装，因为我的是64位机，并且把这个新的版本安装在更新之前版本的同一个文件夹位置，方便我管理，安装成功后，把原先版本的R包允许拷贝到新版本下，同时，保留原先版本的R包，并且把相应的配置文件也拷贝到R新版本下，接受新版本下R包的更新操作。把这些事情都弄完了，就耐心地等待R包的拷贝和更新，完成后，会提示是否需要使用R新版本启动RGui，如下图：

点击是，R新版本启动成功后，如下图所示。

第二、迁移R包

其实这一部分也很简单，就是找到旧版本的R包，并将其复制粘贴到新版本的文件夹中即可.

首先可以直接在Windows自带的搜索框中随便搜索一个以前安装过的包，然后打开文件路径即可找到之前所有包所在的位置。

查询R包安装位置-注意代码.前面有空格

 .libPaths()

运行结果一般有2个目录，第一个目录是当前用户的目录，当前用户有写入权限;第二个为系统级别的目录，对所有用户适用

结果：[1] "C:/Users/WD/AppData/Local/R/win-library/4.3" "C:/Program Files/R/R-4.3.1/library"     

第三、Rstudio选择R新版本

打开RStudio，点击工具栏Tools，选择Global Options，配置安装好的R新版本。具体操作如下图所示：

实际上，你会发现，把R版本自动更新后，RStudio会自动选择更新版作为默认的R版本，若是要切回到原先的版本，就只需要在上图中矩形方框里面选择你感兴趣的R版本即可。

第四、现在测试在R新版本下安装tune包。

发现R新版本，加载tune包，没有报错了，可以直接工作了。