单基因-生信科研网

肿瘤单基因超级混合分析-狂人DH153

肿瘤单基因超级混合分析传统的肿瘤单基因数据挖掘都是完全依赖生信分析的，如果全部分析都是依赖生信分析的话，有很多问题没有办法解决，例如目标基因的表达受什么调控？该基因通过什么来促进或者抑制肿瘤的发生发展？目前基本肿瘤单基因数据挖掘只能做到这个层面，目标基因在肿瘤组织表达异常，该基因生存分析有统计学意义...

生信挖掘
2024-12-22 11:16:58
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GEO数据库联合孟德尔随机化视频(单基因孟德尔随机化/MR)G177

GEO数据库联合孟德尔随机化视频(单基因孟德尔随机化/MR) 1.GEO数据库孟德尔随机化简介2.软件准备3.GEO数据下载4.GEO数据注释5.差异分析6.WGCNA筛选疾病相关基因7.交集基因8.GO富集分析(功能)9.KEGG富集分析(通路)10.蛋白互作网络11.网络核心基因(cytoHubba)12.ROC曲线13.列线图14.免疫细胞浸润15.免疫细胞热图16.免疫细胞差...

孟德尔套路
2023-07-04 23:19:32
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非肿瘤单基因生信套路(机器学习/随机森林树/ceRNA调控网络)GEO数据库G171

非肿瘤单基因生信套路(机器学习/随机森林树/ceRNA调控网络)一、非肿瘤单基因生信套路简介二、软件准备三、GEO数据下载四、GEO数据注释五、单个数据矫正六、多个实验数据合并七、PCA分析八、差异分析九、差异基因火山图十、Lasso回归筛选疾病特征基因十一、SVM机器学习筛选疾病特征基因十二、随机森林树选疾病特征基因十三、...

非肿瘤套路
2023-04-23 21:46:51
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疾病单基因mfuzz表达模式聚类结合ssgsea分析联合CIBERSORT免疫浸润思路生信碱移YS06

疾病单基因mfuzz表达模式聚类结合ssgsea分析联合CIBERSORT免疫浸润思路169rMfuzz包最初是为处理基因表达或蛋白表达谱数据而开发的一种聚类方法，核心算法基于模糊c均值聚类（Fuzzy C-Means Clustering，FCM），用于在具有时间序列特征的转录组、蛋白质组数据中分析基因或蛋白表达的时间趋势，并将具有相似表达模式的基因或蛋...

生信挖掘
2023-02-05 22:27:24
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单基因免疫细胞浸润4+生信套路视频CCLE联合TCGA数据库G123

单基因免疫细胞浸润4+生信套路视频生信分析报告一、单基因免疫细胞浸润二、转录组数据下载三、转录组数据整理四、id转换五、临床数据下载六、临床数据整理七、基因差异分析八、基因生存分析九、免疫细胞浸润十、免疫细胞浸润可视化十一、免疫细胞差异分析十二、基因与免疫细胞相关性十三、拷贝数和免疫细胞关系十四、CCLE数...

肿瘤套路
2022-08-10 10:11:08
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肿瘤单基因文章套路(免疫组化+免疫治疗+药物敏感性)TCGA数据库G145

肿瘤单基因文章套路(免疫组化+免疫治疗+药物敏感性)生信分析报告一、单基因文章套路简介二、转录组数据下载三、转录组数据整理四、id转换五、临床数据下载六、临床数据整理七、泛癌的差异分析八、单个肿瘤差异分析九、配对差异分析十、生存分析十一、PFS分析十二、ROC曲线十三、临床相关性分析十四、临床相关性的热图十五、...