TCGA-生信科研网

TCGA数据库+网络毒理学+预后SHAP分析10分文章套路视频G234

TCGA数据库+网络毒理学+预后SHAP分析10分文章套路视频1200r课程目录1.TCGA数据库联合网络毒理学简介2.软件安装3.转录组数据下载4.转录组数据整理5.临床数据下载6.提取临床信息7.区分mRNA和lncRNA8.差异分析9.化合物(PubChem)10.化合物靶点(ChEMBL)11.化合物靶点(SwissTargetPrediction)12.化合物靶点(SEA)13.化合物靶点取并...

肿瘤套路
2025-08-18 17:28:13
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预后模型SHAP可解释性分析视频(生存数据SHAP分析TCGA数据库)G222

预后模型SHAP可解释性分析视频(生存数据SHAP分析TCGA数据库)1100r1课程目录1.预后模型SHAP分析简介2.软件安装3.转录组数据下载4.转录组数据整理5.临床数据下载6.提取临床信息7.区分mRNA和lncRNA8.GEO数据下载9.GEO数据注释10.TCGA突变数据下载11.计算肿瘤突变负荷12.查找外泌体相关的基因13.差异分析14.GO富集分析(功能)15....

肿瘤套路
2025-04-20 22:32:13
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2024新版TCGA数据下载和整理视频(转录组临床miRNA突变)G195

2024新版TCGA数据下载和整理视频(转录组临床miRNA突变)450r 课程目录1.新版TCGA下载和数据整理简介2.软件安装3.转录组数据下载4.转录组数据整理5.临床数据下载6.提取临床信息7.miRNA数据下载8.miRNA数据合并9.miRNA数据id转换10.TCGA突变数据下载11.计算肿瘤突变负荷...

肿瘤套路
2024-07-17 16:49:24
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TCGAm6a+lncRNA分析套路-组学大讲堂DK29

TCGAm6a+lncRNA分析套路499r适用人群科研院所、大学老师、学生等课程概述介绍TCGA数据挖掘，分析m6a相关lncRNA预后模型课程目录3 文献解读.mp44 TCGA数据下载和处理(InRNA，mRNA).mp45 相关性分析(m6a与IncRNA).mp46 m6a相关IncRNA构建预后模型.mp47 特征基因的区分能力(主成分分析).mp48 特征基因与免疫浸润之间相关性分析...

生信挖掘
2024-07-14 15:50:23
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重磅课程代码：单细胞测序结合 GWAS 关联细胞亚群+ TCGA 贝叶斯反卷积+ SMR 多组学生信碱移YS11

重磅课程代码：单细胞测序结合 GWAS 关联细胞亚群+ TCGA 贝叶斯反卷积+ SMR 多组学249r单细胞测序能够鉴定各种疾病特异性的细胞群体，以分析疾病相关的病理转归与治疗应答。尽管如此，单细胞测序数据受限于较少的样本量，难以通过性状关联、预后关联的方式鉴定核心的细胞亚群。许多计算模型和算法被相继提出，用于评价组织水...

生信挖掘
2024-07-13 11:23:39
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续新-肿瘤数据挖掘大师课TM00 (包含Depmap, ENCODE, CCLE，TCGA等数据)果子GZ57

肿瘤数据挖掘大师课TM00 (包含Depmap, ENCODE, CCLE，TCGA等数据)3200r商品详情课程当前代号是TM00，内部第一期已经运行。当前参加就是内部第二期(同时拥有第一期和第二期的学习权限)本次课程架构恢弘，旨在释放团队积累的肿瘤数据分析和挖掘的技能，授课时间较长，且需要R语言基础，所以希望你是果子GZ00学员，或者SCO0学员...

生信挖掘
2023-11-21 16:11:53
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TCGA|铁死亡+lncRNA分析套路-组学大讲堂DK28

TCGA|铁死亡+lncRNA分析套路499r课程目录章节1：参考资料下载 (2 任务)01 参考资料下载—TCGA|铁死亡+lncRNA分析套路02 生信学习黄金搭档-组学大讲堂云服务器文档章节2：铁死亡相关lncRNA分析文献讲解 (1 任务)03 铁死亡相关lncRNA分析文献讲解视频|13分钟43秒章节3：铁死亡相关lncRNA分析实操 (7 任务)04 TCGA数据下载与...

生信挖掘
2023-10-07 10:09:04
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TCGA数据库机器学习文章套路(SVM/KNN/Logit/RF/DTS)G176

TCGA数据库机器学习文章套路(SVM/KNN/Logit/RF/DTS) 1.TCGA数据库机器学习简介2.软件准备3.转录组数据下载4.转录组数据整理5.临床数据下载6.提取临床信息7.区分mRNA和lncRNA8.mRNA差异分析9.miRNA数据下载10.miRNA数据合并11.miRNA数据id转换12.miRNA差异分析13.机器学习模型14.特征miRNA差异柱状图15.特征miRNA的ROC曲线16...

肿瘤套路
2023-08-21 13:43:16
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淋巴结转移文章套路(可替换临床性状/分期/转移)TCGA数据库G149

淋巴结转移文章套路(可替换临床性状/分期/转移)1.淋巴结转移文章套路简介2.软件准备3.转录组数据下载4.转录组数据整理5.临床数据下载6.提取临床信息7.区分mRNA和lncRNA8.差异分析(FDR过滤)9.差异分析(pvalue过滤)10.蛋白互作网络11.Cytoscape输入文件准备12.Cytoscape可视化13.网络核心基因14.核心基因差异分析15.GO富集分析...

肿瘤套路
2023-08-17 10:05:20
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TCGA数据库与数据挖掘套路-解螺旋BF15

TCGA数据库与数据挖掘套路139r课程目录1 tcga数据库与数据挖掘套路（00:17:36）2 tcga数据挖掘实战入门（00:18:50）3 数据检索演示加下载演示（00:33:51）4 5分tcga挖掘sci复现（00:45:09）5 代码差异分析（00:59:05）6 在线工具差异分析（00:14:22）7 代码功能富集分析（00:07:53）8 在线工具功能富集分析（00...