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TCGA数据库实战-解螺旋BB08

TCGA数据库实战199r课程目录第1章 TCGA数据库与数据挖掘套路1-1 TCGA数据库与数据挖掘套路（00:42:45）第2章 TCGA数据挖掘实战入门2-1 TCGA数据挖掘实战入门（01:28:43）第3章 5分TCGA挖掘SCI复现3-1 文章介绍（00:13:42）3-2 下载数据及处理临床文件（01:09:06）3-3 处理注释文件（00:20:03）3-4 转化基因名字以及计算...

大数据库
2023-06-03 23:35:16
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双硫死亡文章套路视频(药物敏感性/免疫逃逸和免疫治疗)TCGA数据库G169

双硫死亡文章套路视频(药物敏感性/免疫逃逸和免疫治疗) 课程目录1.双硫死亡文章套路简介2.软件准备3.转录组数据下载4.转录组数据整理5.临床数据下载6.提取临床信息7.区分mRNA和lncRNA8.提取双硫死亡基因的表达量9.共表达分析10.TCGA突变数据下载11.计算肿瘤突变负荷12.桑基图13.lncRNA表达和生存数据合并14.构建预后模型15....

肿瘤套路
2023-05-29 16:58:33
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单个miRNA文章套路(批量化筛选/靶基因/miRNA免疫治疗)TCGA联合TIDE数据库G170

单个miRNA文章套路(批量化筛选/靶基因/miRNA免疫治疗)TCGA联合TIDE数据库一、单个miRNA文章套路简介二、软件准备三、转录组数据下载四、转录组数据整理五、临床数据下载六、提取临床信息七、区分mRNA和lncRNA八、TIDE数据库输入文件九、miRNA数据下载十、miRNA数据合并十一、miRNA数据id转换十二、差异miRNA筛选十三、预后...

肿瘤套路
2023-05-10 13:25:15
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免疫基因结合代谢基因生信套路(双热点联合分析)GEO联合TCGA数据库G165

免疫基因结合代谢基因生信套路(双热点联合分析)一、免疫基因结合代谢基因简介二、软件准备三、转录组数据下载四、转录组数据整理五、临床数据下载六、提取临床信息七、提取免疫基因和代谢基因表达量八、GEO数据下载九、GEO数据注释十、TCGA突变数据下载十一、计算肿瘤突变负荷十二、差异分析十三、提取差异的表达量十四、TC...

肿瘤套路
2023-03-03 13:42:33
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T细胞文章套路视频(单细胞测序联合TCGA数据库)GEO联合TCGA数据库G168

T细胞文章套路视频(单细胞测序联合TCGA数据库)一、T细胞文章套路简介二、软件准备三、转录组数据下载四、转录组数据整理五、临床数据下载六、提取临床信息七、获取免疫相关的基因八、GEO数据下载九、GEO数据注释十、TCGA突变数据下载十一、计算肿瘤突变符合十二、单细胞数据分析十三、T细胞差异基因十四、T细胞基因和免疫基...

肿瘤套路
2023-03-03 13:40:09
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内质网应激lncRNA预后模型联合肿瘤分型生信套路TCGA数据库G164

内质网应激lncRNA预后模型联合肿瘤分型生信套路一、内质网应激lncRNA简介二、软件准备三、转录组数据下载四、转录组数据整理五、临床数据下载六、提取临床信息七、区分mRNA和lncRNA八、内质网应激基因的表达量九、共表达分析十、TCGA突变数据下载十一、计算肿瘤突变负荷十二、lncRNA差异分析十三、lncRNA表达和生存数据合并...

肿瘤套路
2023-02-06 14:11:14
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医学统计园-GEO, TCGA, 单细胞数据分析来啦XZ09

医学统计园-GEO, TCGA, 单细胞数据分析来啦~【发表时间】2022-11-26【医学统计园】在线培训又开始啦~，这次培训是基于R语言进行生物信息分析与数据挖掘。从R语言学习开始进行预热，然后基于公共数据集，开展三类数据挖掘分析，包括：GEO数据分析，TCGA数据分析以及单细胞数据分析。以上为课程大纲，该系列课程将会集中在周六...

单细胞
2023-02-01 22:16:15
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癌症相关成纤维细胞CAF生信套路(EPIC/MCPcounter/xCell)GEO联合TCGA数据库G162

癌症相关成纤维细胞CAF生信套路(EPIC/MCPcounter/xCell)生信分析报告一、癌症相关成纤维细胞简介二、软件准备三、转录组数据下载四、转录组数据整理五、临床数据下载六、提取临床信息七、区分mRNA和lncRNA八、GEO数据下载九、GEO数据注释十、TCGA突变数据下载十一、计算肿瘤突变负荷十二、TCGA数据库CAF打分十三、GEO数据库...

肿瘤套路
2022-12-03 14:26:33
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失巢凋亡预后模型联合单细胞测序文章套路GEO联合TCGA数据库G161

失巢凋亡预后模型联合单细胞测序文章套路生信分析报告一、失巢凋亡文章套路简介二、软件准备三、转录组数据下载四、转录组数据整理五、临床数据下载六、提取临床信息七、失巢凋亡相关的基因八、GEO数据下载九、GEO数据注释十、差异分析十一、数据合并十二、提取差异基因的表达量十三、失巢凋亡基因生存分析十四、预后的网络...

肿瘤套路
2022-12-03 14:22:25
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肿瘤巨噬细胞文章套路视频(Macrophage/免疫细胞浸润)GEO联合TCGA数据库G159

肿瘤巨噬细胞文章套路视频(Macrophage/免疫细胞浸润)生信分析报告一、巨噬细胞文章套路简介二、软件准备三、转录组数据下载四、转录组数据整理五、临床数据下载六、提取临床信息七、免疫细胞浸润八、GEO数据下载九、GEO数据注释十、TCGA突变数据下载十一、计算肿瘤突变负荷十二、共表达分析十三、共表达网络图十四、相关性图...