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TCGA数据库蛋白质组学文章套路(蛋白预后模型/免疫组化)G151

TCGA数据库蛋白质组学文章套路(蛋白预后模型/免疫组化)生信分析报告一、TCGA蛋白质组简介二、软件准备三、转录组数据下载四、转录组数据整理五、临床数据下载六、提取临床信息七、蛋白表达数据下载八、蛋白数据整理九、蛋白表达数据和生存数据合并十、蛋白预后模型构建十一、分组的临床统计分析十二、预后火山图十三、PCA分...

肿瘤套路
2022-07-14 17:11:38
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TCGA数据挖掘分析尔云间YE14

TCGA数据挖掘分析云间YE14技巧ATGC.docx微信课堂二-TCGA的分析思路.pptx微信课堂二-TCGA数据库培训wmv...

大数据库
2022-06-28 13:20:02
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多芯片联合免疫细胞浸润视频(GEO纯生信4+文章套路)联合TCGA数据库G108

多芯片联合免疫细胞浸润视频(GEO纯生信4+文章套路)生信代做报告一、多芯片联合免疫细胞浸润二、软件准备三、GEO数据下载四、GEO数据注释1_symbol五、GEO数据注释2_GB六、单个芯片数据差异分析七、多芯片联合分析八、GO富集分析九、KEGG富集分析十、蛋白互作网络十一、cytoscape输入文件十二、cytoscape可视化十三、网络核心...

肿瘤套路
2022-06-02 21:10:27
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铜死亡多组学文章套路(铜死亡分型/药物敏感性)GEO联合TCGA数据库G150

铜死亡多组学文章套路(铜死亡分型/药物敏感性)生信分析报告一、铜死亡多组学文章套路简介二、软件准备三、转录组数据下载四、转录组数据整理五、临床数据下载六、提取临床信息七、铜死亡基因差异分析八、GEO数据下载九、GEO数据注释十、TCGA突变数据下载十一、计算肿瘤突变负荷十二、铜死亡基因的瀑布图十三、铜死亡基因的拷...

肿瘤套路
2022-05-29 17:00:31
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【生信知识】TCGA癌症类型简写术语中英文对照-样本命名规则和区分是否死亡

TCGA数据库样本命名规则：Project, 所有TCGA样本名均以这个开头，标志；Tissue source site（TSS），组织来源编码，代表的意义详见：https://gdc.cancer.gov/resources-tcga-users/tcga-code-tables/tissue-source-site-codesSample, 这两个数字可以说是最关键，其中编号01~09表示肿瘤，10~19表示正常对照，详见：https://g...

精品汇总
2022-05-25 15:42:29
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2022年最新版本TCGA转录组数据下载狂人DH62

最新版本TCGA转录组数据下载狂人前一段时间TCGA数据库改了版，TCGAbiolinks包原来的代码没有办法获取相关的mRNA和lncRNA数据，但是TCGAbiolinks包的作者很给力，很快就将TCGAbiolinks包进行了更新，所以需要重新安装TCGAbiolinks：if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) in...

大数据库
2022-05-19 21:08:30
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居家防疫7天发文A计划顺利结业(肿瘤)TCGA数据库生信作曲家YQ02

居家防疫7天发文A计划顺利结业(肿瘤)生信作曲家50计划回顾生信作曲家一直致力于构建国内和谐、开放、可持续的生物信息交流平台。生信作曲家的目标是为每个科研人扫清科研路上的一切障碍，让生物信息学人人可做。目前，生信作曲家已推出"跟着一区文章学通机器学习"，"跟着一区文章学通单细胞"，CIBERSOR...

大数据库
2022-05-15 12:18:20
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铜死亡文章套路视频(lncRNA预后模型/免疫治疗/药物敏感性)TCGA数据库G148

铜死亡文章套路视频(lncRNA预后模型/免疫治疗/药物敏感性)生信分析报告一、铜死亡lncRNA文章套路简介二、软件准备三、转录组数据下载四、转录组数据整理五、临床数据下载六、提取临床信息七、区分mRNA和lncRNA八、提取铜死亡相关基因的表达量九、共表达分析十、TCGA突变数据下载十一、计算肿瘤突变负荷十二、桑基图十三、ln...

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2022-04-21 21:37:02
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肿瘤单基因文章套路(免疫组化+免疫治疗+药物敏感性)TCGA数据库G145

肿瘤单基因文章套路(免疫组化+免疫治疗+药物敏感性)生信分析报告一、单基因文章套路简介二、转录组数据下载三、转录组数据整理四、id转换五、临床数据下载六、临床数据整理七、泛癌的差异分析八、单个肿瘤差异分析九、配对差异分析十、生存分析十一、PFS分析十二、ROC曲线十三、临床相关性分析十四、临床相关性的热图十五、...

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2022-03-19 09:33:14
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脂肪酸代谢文章套路(免疫治疗/药物敏感性)GEO联合TCGA数据库G144

脂肪酸代谢文章套路(免疫治疗/药物敏感性)生信分析报告一、脂肪酸代谢文章套路二、转录组数据下载三、转录组数据整理四、id转换五、临床数据下载六、临床数据整理七、脂肪酸代谢基因的表达量八、GEO数据下载九、GEO数据注释十、TCGA突变数据下载十一、计算肿瘤突变负荷十二、差异分析十三、提取差异基因的表达量十四、TCGA表...