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药食同源文章套路(网络药理学+GEO数据库+分子对接)G227

药食同源文章套路(网络药理学+GEO数据库+分子对接)1100r课程简介1.药食同源分析简介2.软件安装3.GEO数据下载4.GEO数据注释5.单个数据矫正6.多芯片数据合并7.PCA分析8.差异分析9.查找药物的成分10.药物成分筛选11.药物成分的靶点12.药物的靶基因13.疾病相关的基因(GeneCards)14.疾病相关的基因(OMIM)15.疾病相关的基因(TTD)1...

非肿瘤套路
2025-07-07 10:48:37
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基因eQTL孟德尔随机化视频(GEO数据库联合MR)G187

基因eQTL孟德尔随机化视频(GEO数据库联合MR)1100r 课程目录1.基因eQTL孟德尔随机化简介2.软件准备3.GEO数据下载4.GEO数据注释5.单个数据矫正6.多芯片数据合并7.PCA分析8.差异分析9.查找暴露数据(基因eQTL)10.查找结局数据11.去除弱工具变量(F检验值10)12.孟德尔随机化分析13.IVW筛选疾病相关的基因14.交集基因15.交集基因MR...

孟德尔套路
2023-12-04 20:02:33
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GEO数据库联合孟德尔随机化视频(单基因孟德尔随机化/MR)G177

GEO数据库联合孟德尔随机化视频(单基因孟德尔随机化/MR) 1.GEO数据库孟德尔随机化简介2.软件准备3.GEO数据下载4.GEO数据注释5.差异分析6.WGCNA筛选疾病相关基因7.交集基因8.GO富集分析(功能)9.KEGG富集分析(通路)10.蛋白互作网络11.网络核心基因(cytoHubba)12.ROC曲线13.列线图14.免疫细胞浸润15.免疫细胞热图16.免疫细胞差...

孟德尔套路
2023-07-04 23:19:32
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零基础GEO数据库数据挖掘-解螺旋BB13

零基础GEO数据库数据挖掘129r课程目录1 如何通过数据挖掘发表高分文章（00:18:13）2 Geo数据库简介及数据下载（00:14:49）3 GEO2R在线分析工具（00:06:00）4 GEOexplorer工具（00:10:13）5 差异基因筛选（00:32:01）6 功能富集分析：KEGG/GO分析&GSEA分析（00:17:43）7 交互互作网络构建（00:21:24）8 临床结果验...

生信挖掘
2023-06-05 21:40:49
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非肿瘤单基因生信套路(机器学习/随机森林树/ceRNA调控网络)GEO数据库G171

非肿瘤单基因生信套路(机器学习/随机森林树/ceRNA调控网络)一、非肿瘤单基因生信套路简介二、软件准备三、GEO数据下载四、GEO数据注释五、单个数据矫正六、多个实验数据合并七、PCA分析八、差异分析九、差异基因火山图十、Lasso回归筛选疾病特征基因十一、SVM机器学习筛选疾病特征基因十二、随机森林树选疾病特征基因十三、...

非肿瘤套路
2023-04-23 21:46:51
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免疫基因结合代谢基因生信套路(双热点联合分析)GEO联合TCGA数据库G165

免疫基因结合代谢基因生信套路(双热点联合分析)一、免疫基因结合代谢基因简介二、软件准备三、转录组数据下载四、转录组数据整理五、临床数据下载六、提取临床信息七、提取免疫基因和代谢基因表达量八、GEO数据下载九、GEO数据注释十、TCGA突变数据下载十一、计算肿瘤突变负荷十二、差异分析十三、提取差异的表达量十四、TC...

肿瘤套路
2023-03-03 13:42:33
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T细胞文章套路视频(单细胞测序联合TCGA数据库)GEO联合TCGA数据库G168

T细胞文章套路视频(单细胞测序联合TCGA数据库)一、T细胞文章套路简介二、软件准备三、转录组数据下载四、转录组数据整理五、临床数据下载六、提取临床信息七、获取免疫相关的基因八、GEO数据下载九、GEO数据注释十、TCGA突变数据下载十一、计算肿瘤突变符合十二、单细胞数据分析十三、T细胞差异基因十四、T细胞基因和免疫基...

肿瘤套路
2023-03-03 13:40:09
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非肿瘤多芯片联合分析8+文章套路(疾病诊断基因/免疫细胞浸润)GEO数据库G163

非肿瘤多芯片联合分析8+文章套路(疾病诊断基因/免疫细胞浸润)一、非肿瘤多芯片联合分析简介二、软件准备三、GEO数据下载四、GEO数据注释五、单个数据差异分析六、多芯片联合分析(RRA)七、数据合并八、箱线图九、PCA分析十、批次矫正差异分析十一、交集差异分析十二、GO富集分析十三、KEGG富集分析十四、蛋白互作网络十五、C...

非肿瘤套路
2023-02-28 16:20:41
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非肿瘤自噬基因文章套路(逻辑回归模型)GEO数据库G166

非肿瘤自噬基因文章套路(逻辑回归模型)一、非肿瘤自噬基因文章套路简介二、软件准备三、GEO数据下载四、GEO数据注释五、差异分析六、差异基因和自噬基因取交集七、交集基因热图八、GO富集分析九、KEGG富集分析十、Metascape分析(疾病)十一、GSEA富集分析十二、lasso回归疾病特征基因十三、逻辑回归模型十四、模型基因热图十...

非肿瘤套路
2023-02-19 13:55:47
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单细胞测序数据挖掘视频（GEO数据库/scRNA-seq/PCA/ tSNE）G71

单细胞测序数据挖掘视频（GEO数据库/scRNA-seq/PCA/ tSNE）P1一、单细胞测序数据挖掘简介二、数据下载三、数据整理四、数据过滤和标准化mp4五、PCA主成分分析六、TSNE聚类分析和marker基因七、注释细胞类型八、细胞轨迹分析九、marker基因ID转换十、GO富集分析十一、GO围图绘制十二、KEGG富集分析十三、KEGG圈图绘制...