GEO-生信科研网

医学统计园-GEO, TCGA, 单细胞数据分析来啦XZ09

医学统计园-GEO, TCGA, 单细胞数据分析来啦~【发表时间】2022-11-26【医学统计园】在线培训又开始啦~，这次培训是基于R语言进行生物信息分析与数据挖掘。从R语言学习开始进行预热，然后基于公共数据集，开展三类数据挖掘分析，包括：GEO数据分析，TCGA数据分析以及单细胞数据分析。以上为课程大纲，该系列课程将会集中在周六...

单细胞
2023-02-01 22:16:15
0
生信科研网

【9天大课】慢直播R语言与GEO数据挖掘（2020）基因课YJ04

大数据库
2022-12-03 23:30:37
0
生信科研网

癌症相关成纤维细胞CAF生信套路(EPIC/MCPcounter/xCell)GEO联合TCGA数据库G162

癌症相关成纤维细胞CAF生信套路(EPIC/MCPcounter/xCell)生信分析报告一、癌症相关成纤维细胞简介二、软件准备三、转录组数据下载四、转录组数据整理五、临床数据下载六、提取临床信息七、区分mRNA和lncRNA八、GEO数据下载九、GEO数据注释十、TCGA突变数据下载十一、计算肿瘤突变负荷十二、TCGA数据库CAF打分十三、GEO数据库...

肿瘤套路
2022-12-03 14:26:33
0
生信科研网

失巢凋亡预后模型联合单细胞测序文章套路GEO联合TCGA数据库G161

失巢凋亡预后模型联合单细胞测序文章套路生信分析报告一、失巢凋亡文章套路简介二、软件准备三、转录组数据下载四、转录组数据整理五、临床数据下载六、提取临床信息七、失巢凋亡相关的基因八、GEO数据下载九、GEO数据注释十、差异分析十一、数据合并十二、提取差异基因的表达量十三、失巢凋亡基因生存分析十四、预后的网络...

肿瘤套路
2022-12-03 14:22:25
0
生信科研网

非肿瘤双疾病联合分析8+文章套路视频(生物信息学)GEO数据库G160

双疾病联合分析8+文章套路视频(生物信息学)生信分析报告一、双疾病联合分析文章套路二、软件准备三、GEO数据下载四、GEO数据注释五、差异分析六、交集基因七、GO富集分析八、KEGG富集分析九、蛋白互作网络十、Cytoscape输入文件准备十一、Cytoscape可视化十二、查找子网络十三、网络核心基因十四、GeneMANIA网络十五、核心基...

非肿瘤套路
2022-11-14 19:40:42
0
生信科研网

肿瘤巨噬细胞文章套路视频(Macrophage/免疫细胞浸润)GEO联合TCGA数据库G159

肿瘤巨噬细胞文章套路视频(Macrophage/免疫细胞浸润)生信分析报告一、巨噬细胞文章套路简介二、软件准备三、转录组数据下载四、转录组数据整理五、临床数据下载六、提取临床信息七、免疫细胞浸润八、GEO数据下载九、GEO数据注释十、TCGA突变数据下载十一、计算肿瘤突变负荷十二、共表达分析十三、共表达网络图十四、相关性图...

肿瘤套路
2022-11-14 19:32:30
0
生信科研网

非肿瘤铜死亡文章套路视频(机器学习模型比较/WGCNA)GEO数据库G158

非肿瘤铜死亡文章套路视频(机器学习模型比较/WGCNA)生信分析报告一、非肿瘤铜死亡简介二、软件准备三、GEO数据下载四、GEO数据注释五、数据矫正六、提取铜死亡基因的表达量七、差异分析八、圏图的输入文件九、绘制铜死亡基因圏图十、相关性分析十一、免疫细胞浸润十二、免疫细胞差异分析十三、免疫细胞相关性分析十四、样品...

非肿瘤套路
2022-09-26 15:53:17
0
生信科研网

(录播,非高清)非肿瘤铁死亡文章套路视频(药物调控网络/机器学习)GEO数据库G156

非肿瘤铁死亡文章套路视频(药物调控网络/机器学习)生信分析报告一、非肿瘤铁死亡简介二、软件准备三、GEO数据下载四、GEO数据注释五、数据矫正六、提取铁死亡基因的表达量七、差异分析八、相关性分析九、GO富集分析十、KEGG富集分析十一、Lasso回归筛选特征基因十二、SVM-RFE机器学习十三、交集基因十四、ROC曲线十五、GSEA...

非肿瘤套路
2022-08-25 22:19:27
0
生信科研网

细胞通讯文章套路视频(单细胞测序联合bulk数据)GEO数据库G155

细胞通讯文章套路视频(单细胞测序联合bulk数据)生信分析报告一、细胞通讯简介二、软件准备三、GEO数据下载四、GEO数据注释五、差异分析六、火山图七、交集差异基因八、GO富集分析九、KEGG富集分析十、免疫细胞浸润十一、免疫细胞差异分析十二、蛋白互作网络十三、Cytoscape输入文件准备十四、Cytoscape可视化十五、查找网络...

非肿瘤套路
2022-08-10 09:27:53
0
生信科研网

免疫原性细胞死亡文章套路视频(免疫治疗反应)GEO联合TCGA数据库G153

免疫原性细胞死亡文章套路视频(免疫治疗反应)生信分析报告一、免疫原性细胞死亡简介二、软件准备三、转录组数据下载四、转录组数据整理五、临床数据下载六、提取临床信息七、提取ICD相关基因的表达量八、GEO数据下载九、GEO数据注释十、TCGA突变数据下载十一、计算肿瘤突变负荷十二、差异分析十三、蛋白互作网络十四、ICD基...