单细胞-生信科研网

掌握Python，解锁单细胞数据的无限可能-生信技能树IJ68

掌握Python，解锁单细胞数据的无限可能1280r单细胞数据分析炙手可热，python在单细胞分析里占据的地位也越来越重要。因为很多工具是基于python原生态开发的，而且在Python编程环境下运行速度会是R编程语言的10倍以上。比如转录因子分析，它作为单细胞的3大高级分析，大家应该是不再陌生，我们也多次介绍过：SCENIC转录因子分...

单细胞
2025-08-08 16:31:39
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机器学习+人工神经网络+单细胞测序+共定位+分子对接8分生信套路G232

机器学习+人工神经网络+单细胞测序+共定位+分子对接8分生信套路1300r课程目录1.机器学习联合人工神经网络2.软件安装3.GEO数据下载4.GEO数据注释5.单个数据矫正6.多芯片数据合并7.箱线图8.PCA分析9.差异分析10.WGCNA共表达分析11.差异基因和WGCNA模块基因取交集12.GO富集分析(功能)13.KEGG富集分析(通路)14.DO富集分析(疾病)...

肿瘤套路
2025-07-26 22:07:40
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单细胞hdWGCNA共表达分析(单细胞人工注释 + bulk数据验证)G229

单细胞hdWGCNA共表达分析(单细胞人工注释 + bulk数据验证)1200r课程目录1.单细胞hdWGCNA分析简介2.软件安装3.单细胞数据下载4.单细胞数据整理5.单细胞数据分析6.细胞通讯7.单细胞人工注释8.hdWGCNA分析9.GO富集分析(功能)10.KEGG富集分析(通路)11.DO富集分析(疾病)12.GEO数据下载芯片数据(Bulk)13.GEO数据注释14.单个数据矫...

肿瘤套路
2025-07-07 20:34:06
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热点基因超级混合分析联合单细胞分析狂人DH162

热点基因超级混合分析联合单细胞分析生信分析+eQTL+pQTL分析可以解决表达+功能问题，目前大部分文章只做到这个层面，生信分析+eQTL+pQTL分析+QTL中介分析可以解决表达+功能+作用机制问题，具体的逻辑关系与解决手段如下图：上面的超级混合分析能够解决以下四个问题：1、基因的表达是否有差异？（疾病VS正常组织）2、基因是好...

单细胞
2025-03-27 22:19:47
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WGCNA（scWGCNA & hdWGNCA）在单细胞空间数据分析中的运用-单细胞空间交响乐ZA49

分析总结----WGCNA（scWGCNA & hdWGNCA）在单细胞空间数据分析中的运用200r作者，Evil Genius偷个懒，不看文章了，总结一下关于WGCNA的分析内容。WGCNA运用很广，在文章中一般作为补充分析存在，例如下面的结果还有单细胞空间联合的WGCNA分析我们就来梳理一下有关WGCNA（包括scWGCNA & hdWGNCA）在单细胞空间数据中...

单细胞
2024-12-23 10:42:25
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单细胞联合空间转录组数据分析(Spatial transcriptome)G216

单细胞联合空间转录组数据分析(Spatial transcriptome)1200r课程目录1.单细胞联合空间转录组简介2.软件安装3.单细胞数据下载4.单细胞数据整理5.单细胞数据分析6.细胞通讯7.空间转录组数据下载8.空间转录组数据整理9.空间转录组数据分析10.单细胞和空间转录组联合分析11.MIA分析12.多样品联合分析13.多样品MIA分析14.GO富集分...

肿瘤套路
2024-12-23 10:40:12
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多样本单细胞数据分析（多种差异分析）狂人DH148

多样本单细胞数据分析（多种差异分析）随着单细胞测序的价格不断下降，单细胞测序的样本数量不断增加，越来越多，这个时候就需要考虑将多个样本数据进行合并分析，差异分析的条件就有更多的选择，可以满足更多的科研目的，无论是你发文章、开题、申请课题都是非常多的思路。做分析的时候需要批量读入每一个样本的单细胞数据...

单细胞
2024-12-22 10:48:19
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单细胞联合eQTL-pQTL分析发文思路（实操版）狂人DH147

单细胞联合eQTL-pQTL分析发文思路（实操版）上次分享了单细胞在eQTL-pQTL数据挖掘中的应用，很多人弄清楚了单细胞分析在eQTL-pQTL数据挖掘中的验证，但是利用单细胞分析筛选靶点基因还是不会操作，找不到切入点，所以这次我们重点分享一下将单细胞分析放在最前面，利用单细胞分析作为切入点，再联合eQTL、pQTL数据挖掘分析的...

孟德尔
2024-12-22 10:32:21
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2024年外显子分析系列课程-单细胞空间交响乐XZ97

2024年外显子分析系列课程1500r作者，Evil Genius多次在单细胞空间系列课程上提到过外显子分析，其中2024年的第一课，就是单细胞联合外显子的数据分析。课表如下（美国人教的，看看效果怎么样）：第一节：外显子分析基础知识与框架（包括基础文件的格式等）第二节：fastq数据处理到call SNV + 基础认知（简单判断谱系突变和...

生信挖掘
2024-11-20 11:39:21
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孟德尔随机化+网络药理学+单细胞测序的文章套路G213

孟德尔随机化+网络药理学+单细胞测序的文章套路1000r课程目录1.课程简介2.软件安装3.提取暴露数据4.查找结局数据5.去除弱工具变量6.孟德尔随机化分析7.筛选疾病相关的蛋白8.反向孟德尔随机化9.森林图10.圈图11.火山图12.曼哈顿图13.GO富集分析(功能)14.KEGG富集分析(通路)15.蛋白互作网络16.网络核心基因(cytoHubba)17.药物...