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热点基因超级混合分析联合单细胞分析狂人DH162
热点基因超级混合分析联合单细胞分析生信分析+eQTL+pQTL分析可以解决表达+功能问题,目前大部分文章只做到这个层面,生信分析+eQTL+pQTL分析+QTL中介分析可以解决表达+功能+作用机制问题,具体的逻辑关系与解决手段如下图:上面的超级混合分析能够解决以下四个问题:1、基因的表达是否有差异?(疾病VS正常组织)2、基因是好...
单细胞
2025-03-27 22:19:47
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生信科研网
WGCNA(scWGCNA & hdWGNCA)在单细胞空间数据分析中的运用-单细胞空间交响乐
分析总结----WGCNA(scWGCNA & hdWGNCA)在单细胞空间数据分析中的运用200r作者,Evil Genius偷个懒,不看文章了,总结一下关于WGCNA的分析内容。WGCNA运用很广,在文章中一般作为补充分析存在,例如下面的结果还有单细胞空间联合的WGCNA分析我们就来梳理一下有关WGCNA(包括scWGCNA & hdWGNCA)在单细胞空间数据中...
单细胞
2024-12-23 10:42:25
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生信科研网
单细胞联合空间转录组数据分析(Spatial transcriptome)G216
单细胞联合空间转录组数据分析(Spatial transcriptome)1200r课程目录1.单细胞联合空间转录组简介2.软件安装3.单细胞数据下载4.单细胞数据整理5.单细胞数据分析6.细胞通讯7.空间转录组数据下载8.空间转录组数据整理9.空间转录组数据分析10.单细胞和空间转录组联合分析11.MIA分析12.多样品联合分析13.多样品MIA分析14.GO富集分...
肿瘤套路
2024-12-23 10:40:12
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生信科研网
多样本单细胞数据分析(多种差异分析)狂人DH148
多样本单细胞数据分析(多种差异分析)随着单细胞测序的价格不断下降,单细胞测序的样本数量不断增加,越来越多,这个时候就需要考虑将多个样本数据进行合并分析,差异分析的条件就有更多的选择,可以满足更多的科研目的,无论是你发文章、开题、申请课题都是非常多的思路。做分析的时候需要批量读入每一个样本的单细胞数据...
单细胞
2024-12-22 10:48:19
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生信科研网
单细胞联合eQTL-pQTL分析发文思路(实操版)狂人DH147
单细胞联合eQTL-pQTL分析发文思路(实操版)上次分享了单细胞在eQTL-pQTL数据挖掘中的应用,很多人弄清楚了单细胞分析在eQTL-pQTL数据挖掘中的验证,但是利用单细胞分析筛选靶点基因还是不会操作,找不到切入点,所以这次我们重点分享一下将单细胞分析放在最前面,利用单细胞分析作为切入点,再联合eQTL、pQTL数据挖掘分析的...
孟德尔
2024-12-22 10:32:21
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生信科研网
2024年外显子分析系列课程-单细胞空间交响乐XZ97
2024年外显子分析系列课程1500r作者,Evil Genius多次在单细胞空间系列课程上提到过外显子分析,其中2024年的第一课,就是单细胞联合外显子的数据分析。课表如下(美国人教的,看看效果怎么样):第一节:外显子分析基础知识与框架(包括基础文件的格式等)第二节:fastq数据处理到call SNV + 基础认知(简单判断谱系突变和...
生信挖掘
2024-11-20 11:39:21
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生信科研网
孟德尔随机化+网络药理学+单细胞测序的文章套路G213
孟德尔随机化+网络药理学+单细胞测序的文章套路1000r课程目录1.课程简介2.软件安装3.提取暴露数据4.查找结局数据5.去除弱工具变量6.孟德尔随机化分析7.筛选疾病相关的蛋白8.反向孟德尔随机化9.森林图10.圈图11.火山图12.曼哈顿图13.GO富集分析(功能)14.KEGG富集分析(通路)15.蛋白互作网络16.网络核心基因(cytoHubba)17.药物...
孟德尔套路
2024-11-18 21:57:38
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生信科研网
单细胞分析在eQTL-pQTL数据挖掘中的应用-狂人DH146
单细胞分析在eQTL-pQTL数据挖掘中的应用今天分享一下单细胞分析在eQTL-pQTL数据挖掘中的应用,很多人想将单细胞分析与eQTL-pQTL数据挖掘联系起来,但是不知道怎么样入手,下面分享一下单细胞分析在eQTL-pQTL数据挖掘中的应用步骤与思路。单细胞分析在eQTL-pQTL数据挖掘中的应用无非就两个方面,第一就是单细胞分析在最后:使...
单细胞
2024-10-18 16:03:06
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生信科研网
cis-pQTL联合单细胞分析-狂人DH145
cis-pQTL联合单细胞分析今天分享一篇8.7分的cis-pQTL联合单细胞分析SCI论文思路,这篇文章来源期刊详细信息如下:文章的具体思路与步骤如下:1、冰岛pQTL数据的下载、结局数据的下载2、批量提取cis-pQTL数据3、过滤提取好的cis-pQTL数据4、批量cis-pQTL孟德尔随机化分析5、批量共定位分析进一步筛选靶点6、靶点基因的验证(...
单细胞
2024-10-18 16:00:25
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生信科研网
零基础高分单细胞联合孟德尔随机化分析课程速发SCI课程-生信私学YX91
零基础高分单细胞联合孟德尔随机化分析课程速发SCI课程1799rSCI论文如何急速发表?0基础高分单细胞联合孟德尔随机化分析课程速发SCI课程可做内容覆盖范围广(医学、心理学、经济学等领域),是新的研究方法,很少人会,期刊、单位都接受,可简单、快速发高分SCI论文,内容包括01.课程简介02.软件安装和调试03.单细胞数...
孟德尔
2024-09-19 12:56:01
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