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内质网应激lncRNA预后模型联合肿瘤分型生信套路TCGA数据库G164

内质网应激lncRNA预后模型联合肿瘤分型生信套路一、内质网应激lncRNA简介二、软件准备三、转录组数据下载四、转录组数据整理五、临床数据下载六、提取临床信息七、区分mRNA和lncRNA八、内质网应激基因的表达量九、共表达分析十、TCGA突变数据下载十一、计算肿瘤突变负荷十二、lncRNA差异分析十三、lncRNA表达和生存数据合并...

肿瘤套路
2023-02-06 14:11:14
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疾病单基因mfuzz表达模式聚类结合ssgsea分析联合CIBERSORT免疫浸润思路生信碱移YS06

疾病单基因mfuzz表达模式聚类结合ssgsea分析联合CIBERSORT免疫浸润思路169rMfuzz包最初是为处理基因表达或蛋白表达谱数据而开发的一种聚类方法，核心算法基于模糊c均值聚类（Fuzzy C-Means Clustering，FCM），用于在具有时间序列特征的转录组、蛋白质组数据中分析基因或蛋白表达的时间趋势，并将具有相似表达模式的基因或蛋...

生信挖掘
2023-02-05 22:27:24
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套路二：端粒酶相关基因在肿瘤中作用生信豆芽菜YU02

套路二：端粒酶相关基因在肿瘤中作用癌细胞可以通过端粒无限增殖，其中涉及到的机制包括由TERT介导的端粒酶依赖性延长以及与ATRX或DAXX缺失相关的端粒选择性延长(ALT)。本文通过端粒酶相关基因分析在肿瘤中的作用，并构建风险模型。本文以肺腺癌为例，进行相关结果的展示，有兴趣者可联系小编。代码和文件夹的介绍01.data.p...

生信挖掘
2023-02-05 20:59:29
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（11.19-12.11）肿瘤发文计划RS！单细胞结合Bulk创领未来2022年！生信作曲家YQ06

（11.19-12.11，含必读Q&A）肿瘤发文计划RS来了！单细胞结合Bulk创领未来，2022年末提升自我！【发布时间】2022-11-15计划详情生信作曲家一直致力于构建国内和谐、开放、可持续的生物信息交流平台。生信作曲家的目标是为每个科研人扫清科研路上的一切障碍，让生物信息学人人可做。目前，生信作曲家已推出"跟着一区...

单细胞
2023-02-01 21:52:59
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果子学生信-做更好的培训，果子国庆节5天5晚课程招生简章GZ53

果子学生信-做更好的培训，果子国庆节5天5晚课程招生简章【发表时间】2022-09-13大家好，这是果子R语言数据挖掘课程，国庆节特别专场的招生简章国庆节这一场十分特别，我们想一改传统，换个形式。国庆节的班级有什么特别的？本次国家放假7天，我们第一次集中授课时间是10月1号-10月5号，是5天5晚(是真5天5晚，真的是从...

生信挖掘
2023-02-01 21:42:11
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单细胞双疾病联合bulk转录组测序+GSEA富集分析+CIBERSORT免疫浸润思路生信碱移YS08

重磅课程：单细胞双疾病联合bulk转录组测序+GSEA富集分析+CIBERSORT免疫浸润思路2492022年截至目前，谷歌学术统计单细胞测序方向已发文超2000篇。单细胞测序在单个细胞水平上，对基因组或转录组进行扩增并测序，随后根据细胞特异性表达的标志基因能够将不同谱系细胞从细胞图谱中区分，从而研究细胞的谱系发育、信号通讯、遗...

单细胞
2023-01-19 20:05:08
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套路七-肿瘤加单细胞加成纤维细胞加免疫治疗生信豆芽菜YU07

套路七-肿瘤加单细胞加成纤维细胞加免疫治疗有粉丝向我们私信想复现一篇成纤维细胞的文章，因此我们在解读该文章后会后，对套路进行了复现。参考文章：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9537943/背景：癌症相关成纤维细胞（CAF）参与肿瘤生长、血管生成、转移和治疗耐药性。我们试图探索肝细胞癌（HCC）中的...

单细胞
2023-01-15 16:29:37
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2022.12.7-9 多组学数据分析及挖掘培训班生信会议XZ07

2022.12.7-9 多组学数据分析及挖掘培训班4200随着组学技术的快速发展，单一组学的数据难以系统全面地解析疾病发生发展的复杂机制。通过多组学数据来解析科学问题变得尤为重要，SCI论文发表呈现出导向性的多组学整合发展趋势。那么，面对眼花缭乱的组学数据该如何分析？怎样凝练或寻找自己的科学问题？多组学实验如何设计？利...

组学
2022-12-15 16:31:19
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癌症相关成纤维细胞CAF生信套路(EPIC/MCPcounter/xCell)GEO联合TCGA数据库G162

癌症相关成纤维细胞CAF生信套路(EPIC/MCPcounter/xCell)生信分析报告一、癌症相关成纤维细胞简介二、软件准备三、转录组数据下载四、转录组数据整理五、临床数据下载六、提取临床信息七、区分mRNA和lncRNA八、GEO数据下载九、GEO数据注释十、TCGA突变数据下载十一、计算肿瘤突变负荷十二、TCGA数据库CAF打分十三、GEO数据库...

肿瘤套路
2022-12-03 14:26:33
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【问答】请问有某某疾病的生信套路吗？

经常有新手咨询有某某疾病（比如冠心病、糖尿病、类风关等）的生信套路吗？问这个问题的小伙伴，相信应该是刚刚学习生信分析的，不了解行情。绝大部分的生信课程不会说只针对某一个疾病的，原因如下：其一，如果生信课程只针对某一个疾病（比如冠心病、糖尿病、类风关等），那么需要分析别的疾病就不能学习这个课程了，课程...